As unidades cerâmicas e armazém de produto acabado são também certificados segundo o referencial normativo NP EN ISO 14001 e pelo Sistema Comunitário de Ecogestão e auditoria (EMAS) desde o ano de 2005, no desenvolvimento, produção e comercialização de louça sanitária e no desenvolvimento, produção e comercialização de equipamentos para salas de banho e cozinha.
A certificação do SGQA segundo os referencias anteriormente mencionados, permite demonstrar o compromisso da organização com a qualidade dos seus produtos e serviços, a satisfação dos clientes, bem como a preocupação em melhorar o seu desempenho ambiental.
Anualmente, a Sanindusa define metas e objetivos para o seu sistema de qualidade e ambiente, os quais vai monitorizando ao longo do ano com vista à melhoria contínua.